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Científicos de tres centros españoles descifran el genoma completo del olivo

Científicos de tres centros españoles descifran el genoma completo del olivo

jueves 30 de junio de 2016, 11:49h

29/06/2016 - Un equipo de investigadores del Centro de Regulación Genómica (CRG) de Barcelona, del Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC-­RJB) y del Centro Nacional de Análisis Genómico de Barcelona (CNAG-­CRG) ha arrojado luz sobre el puzzle genético del olivo al lograr secuenciar por primera vez el genoma completo de esta especie.

Los resultados de este trabajo, financiado íntegramente por el Banco Santander, se recogen esta semana en la vanguardista revista de acceso abierto GigaScience. Esta publicación abre las puertas a nuevos trabajos de investigación que servirán para ayudar al olivo, tanto a su desarrollo como a protegerse de infecciones que ahora están causando "verdaderos estragos", como son los ataques de bacterias (Xylella fastidiosa) y hongos (Verticillium dhailae), según ha informado el Centro de Regulación Genómica de Barcelona en un comunicado.
 
Hasta el momento se desconocía el genoma del olivo que regula, por ejemplo, las diferencias entre las variedades, tamaños y sabor de las aceitunas, por qué son tan longevos, o las claves de su adaptación al secano.
 
"Se trata, sin duda, de un árbol emblemático cuya mejora vegetal resulta muy difícil puesto que hay que esperar al menos 12 años para ver qué características morfológicas tendrá y ver si resulta o no interesante para hacer, por ejemplo, cruces", ha destacado Toni Galbaldón, profesor de investigación ICREA y jefe del grupo de genómica comparativa del CRG, que ha liderado este trabajo. En su opinión, "conocer la información genética del olivo nos permitirá ahora contribuir a la mejora de la producción de aceites y aceitunas, de gran relevancia en la economía española". 
 
 
Fases de la investigación
 
La investigación, coordinada por Pablo Vargas, investigador del CSIC en el Real Jardín Botánico, ha durado tres años. "En la secuenciación de un genoma hay tres fases: la primera, aislar todos los genes, que es algo que ya publicamos hace dos años. La segunda, ensamblar el genoma, que es ordenar esos genes uno detrás de otro, como si concatenaramos frases sueltas de un libro. Y, finalmente, identificar todos los genes, es decir, montar el libro. Esas dos últimas fases son las que hemos realizado y presentamos ahora", ha explicado Vargas.
 
Siguiendo con la analogía del libro, para Tyler Alioto del CNAG-­CRG, "este genoma ha generado unos 1,31 mil millones de letras, que son más de 1000 GBytes de datos. Estamos sorprendidos porque hemos detectado más de 56.000 genes, significativamente más que los detectados en genomas secuenciados de plantas relacionadas y el doble que el genoma humano". 
 
 
Descifrar su historia evolutiva
 
Además de la secuenciación completa del genoma del olivo, los investigadores también han comparado el ADN de este árbol milenario con otras variedades como el acebuche (olivo salvaje). Asimismo, han obtenido el transcriptoma, es decir, los genes que se expresan para valorar qué diferencias existen a nivel de expresión génica en hojas, raíces y frutos en diferentes estadios de maduración.
 
El siguiente paso, según han señalado los investigadores, será descifrar la historia evolutiva de este árbol, que forma parte de la vida de las poblaciones del viejo mundo desde que en la Edad de Bronce comenzara un proceso de domesticación a partir del acebuche en el este del Mediterráneo que resultó en los olivos actuales.
 
Posteriores procesos de selección en distintos países del Mediterráneo dieron origen a las cerca de 1.000 variedades de cultivo que contamos hoy día. Conocer la evolución de olivos de distintos países, además, permitirá, a su juicio, averiguar sus orígenes y desentrañar las claves que le han posibilitado adaptarse a condiciones medioambientales muy diversas; también, obtener las claves de su "extraordinaria" longevidad, ya que pueden vivir hasta 3.000 y 4.000 años. "De hecho, esa longevidad convierte al olivo que hemos secuenciado casi en un monumento vivo", ha señalado Gabaldón.
 
"Hasta el momento todos los individuos secuenciados, desde la mosca del vinagre (Drosophila melanogaster) hasta el primer ser humano analizado, han vivido un tiempo determinado, en función de la esperanza de vida de cada especie, pero luego han muerto o morirán. Esta es la primera vez que se secuencia el ADN de un individuo de más de 1.000 años que puede seguir vivo tal vez otro milenio más", han apuntado los investigadores.